La bioinformatique est toujours organisée de façon stupide

En même temps, tout est toujours organisé de façon stupide avec les golems

Mis à part quelques logiciels open source qui remplissent bien leurs fonctions, le reste (open source) est presque toujours merdique

Les seuls logiciels efficaces et fonctionnels pour l'analyse clinique sont presque toujours des logiciels propriétaires

La DB de ClinVar, du n'importe quoi d'ailleurs, n'importe quel golem peut soumettre des variants comme étant pathogénique, résultat des variants très fréquents sont classés comme pathogénique, généralement, les preuves pour la classification sont ridiculement faibles voire inexistantes à ce stade, mais ça n'empêche pas la soumission

D'ailleurs, cette vision des choses, où un variant peut être classifié seulement pathogénique / non pathogénique, et ses dérivés, est totalement stupide

Parfois, le paper à l'origine de la soumission n'est même pas cité et il faut faire des recherches avec le nom des auteurs et des mots clé, pour trouver la source, et ensuite, il faut encore faire un long travail d'analyse sur les variants, les soumissions ClinVar se limitent au strict minimum, c'est de la merde

Les annotations sont merdiques aussi

Surtout, développez vos propres logiciels pour la bioinformatique, ne comptez pas sur ceux des golems (quand vous arrivez à les lancer), ils sont bien souvent inefficaces. Il y a une poignée de logiciels open source que vous pouvez utiliser et qui fonctionnent plus ou moins bien, pour des fonctions basiques : SnpEff, GATK, IGV, SAMtools... et vous pouvez ensuite utiliser ces sorties de données pour une analyse plus approfondie avec vos propres logiciels. Car sinon, c'est des solutions propriétaires à la con, comme VarSome.

C'est un énorme bordel stupide, et les fonctions les plus évidentes pour l'analyse clinique, ne sont pourtant pas assurées

D'ailleurs, là j'ai juste parlé des variants simples, mais par exemple, pour l'identification de variants structuraux ou de séquences hautement répétitives dépassant le cadre de lecture de séquençage... sur des données NGS (qui nécessitent des déductions à partir des fichiers FASTQ), il y a très peu de logiciels open source qui le font correctement au final (même si c'est simple en pratique), pourtant, c'est une évidence qu'il faut un logiciel d'analyse clinique open source et tout-en-un, une pipeline bioinformatique digne de ce nom

Avec les golems, tout est merdique de toute façon

Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :
Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :
Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

Et pourtant tu fait toujours rien de ta vie

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :
Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

Ah ouais ! Le nouveau Aristote ! Le nouveau Leibnitz !

C'est dommage que pourtant tu n'en fasses rien et que tu sois probablement sous perfusion de l'état chez toi

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :
Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

Le 15 juillet 2024 à 21:10:23 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

Et pourtant tu fait toujours rien de ta vie

Avoir des connaissances, c'est déjà faire quelque chose, un préalable indispensable à la venue d'idées intelligentes
Mais les golems stupides ne peuvent pas le comprendre

+ Je ne dis pas tout ce que je fais

Le 15 juillet 2024 à 21:15:42 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

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C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

Tu n’as pas à énoncer de telles choses, khey

Le 15 juillet 2024 à 21:15:55 :

Le 15 juillet 2024 à 21:10:23 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

Et pourtant tu fait toujours rien de ta vie

Avoir des connaissances, c'est déjà faire quelque chose, un préalable indispensable à la venue d'idées intelligentes
Mais les golems stupides ne peuvent pas le comprendre

+ Je ne dis pas tout ce que je fais

Putain t'es probablement le seul khey plus brisé que giuseppe, c'est d'une tristesse kheyou

Le 15 juillet 2024 à 21:15:42 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :
Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

saliax

Le 15 juillet 2024 à 21:15:42 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

On s'en branle de ton indice bidon sur les citations le golem, j'ai longuement critiqué les bullshit papers (y compris les "papers mills" maintenant), qui représentent une part peut-être même majoritaire en médecine, ce n'est pas pour me reposer sur des indices à la con de citations

La course aux citations est l'un des très nombreux cancers

Et sinon, on m'a déjà proposé plein de fois de participer à des papers voire de publier moi-même, mais je ne l'ai jamais fait, et si je le fais, ce ne sera jamais dans un éditeur académique classique, car ce sont des arnaqueurs (l'auteur paye pour publier, le lecteur paye pour regarder, le comité de revue est bénévole) ; heureusement qu'il y a Sci-Hub

Le 15 juillet 2024 à 21:18:48 :

Le 15 juillet 2024 à 21:15:42 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

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allez ferme bien ta gueule maintenant

On s'en branle de ton indice bidon sur les citations le golem, j'ai longuement critiqué les bullshit papers (y compris les "papers mills" maintenant), qui représentent une part peut-être même majoritaire en médecine, ce n'est pas pour me reposer sur des indices à la con de citations

La course aux citations est l'un des très nombreux cancers

Et sinon, on m'a déjà proposé plein de fois de participer à des papers voire de publier moi-même, mais je ne l'ai jamais fait, et si je le fais, ce ne sera jamais dans un éditeur académique classique, car ce sont des arnaqueurs (l'auteur paye pour publier, le lecteur paye pour regarder, le comité de revue est bénévole) ; heureusement qu'il y a Sci-Hub

les revues prédatrices ca compte pas enculé de tes morts

Le 15 juillet 2024 à 21:20:56 :

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Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

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C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

On s'en branle de ton indice bidon sur les citations le golem, j'ai longuement critiqué les bullshit papers (y compris les "papers mills" maintenant), qui représentent une part peut-être même majoritaire en médecine, ce n'est pas pour me reposer sur des indices à la con de citations

La course aux citations est l'un des très nombreux cancers

Et sinon, on m'a déjà proposé plein de fois de participer à des papers voire de publier moi-même, mais je ne l'ai jamais fait, et si je le fais, ce ne sera jamais dans un éditeur académique classique, car ce sont des arnaqueurs (l'auteur paye pour publier, le lecteur paye pour regarder, le comité de revue est bénévole) ; heureusement qu'il y a Sci-Hub

les revues prédatrices ca compte pas enculé de tes morts

Je ne parle pas des revues prédatrices le golem, je parle de grands éditeurs comme Elsevier, tu ne sais même pas comment fonctionne leur modèle stupide

Le 15 juillet 2024 à 21:21:47 :

Le 15 juillet 2024 à 21:20:56 :

Le 15 juillet 2024 à 21:18:48 :

Le 15 juillet 2024 à 21:15:42 :

Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

> Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :

>Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit
C'est pas nouveau la bioinformatique

Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

On s'en branle de ton indice bidon sur les citations le golem, j'ai longuement critiqué les bullshit papers (y compris les "papers mills" maintenant), qui représentent une part peut-être même majoritaire en médecine, ce n'est pas pour me reposer sur des indices à la con de citations

La course aux citations est l'un des très nombreux cancers

Et sinon, on m'a déjà proposé plein de fois de participer à des papers voire de publier moi-même, mais je ne l'ai jamais fait, et si je le fais, ce ne sera jamais dans un éditeur académique classique, car ce sont des arnaqueurs (l'auteur paye pour publier, le lecteur paye pour regarder, le comité de revue est bénévole) ; heureusement qu'il y a Sci-Hub

les revues prédatrices ca compte pas enculé de tes morts

Je ne parle pas des revues prédatrices le golem (qui sont eux aussi des arnaques), je parle de grands éditeurs comme Elsevier, tu ne sais même pas comment fonctionne leur modèle stupide

oui oui el famoso desco qui publie dans nature allez supprime vite maintenant

Le 15 juillet 2024 à 21:24:23 :

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> Le 15 juillet 2024 à 21:04:49 :

>> Le 15 juillet 2024 à 21:04:36 :

> >Toi en fait t'es médecin, architecte, philosophe, mathématicien, ingénieur en aéronautique, en nucléaire, et maintenant en bioinformatique

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> + Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale, depuis que je suis tout petit

> C'est pas nouveau la bioinformatique

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> Il y a des domaines que je maîtrise sur le bout des doigts, d'autre plus ou moins bien mais de plus en plus avec le temps, je fais naturellement plein de recherches sur tout un tas de sujets, et je me pose tout un tas de questions

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> C'est d'ailleurs la différence avec le golem dans un cursus universitaire, et l'érudit https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89rudition

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

On s'en branle de ton indice bidon sur les citations le golem, j'ai longuement critiqué les bullshit papers (y compris les "papers mills" maintenant), qui représentent une part peut-être même majoritaire en médecine, ce n'est pas pour me reposer sur des indices à la con de citations

La course aux citations est l'un des très nombreux cancers

Et sinon, on m'a déjà proposé plein de fois de participer à des papers voire de publier moi-même, mais je ne l'ai jamais fait, et si je le fais, ce ne sera jamais dans un éditeur académique classique, car ce sont des arnaqueurs (l'auteur paye pour publier, le lecteur paye pour regarder, le comité de revue est bénévole) ; heureusement qu'il y a Sci-Hub

les revues prédatrices ca compte pas enculé de tes morts

Je ne parle pas des revues prédatrices le golem (qui sont eux aussi des arnaques), je parle de grands éditeurs comme Elsevier, tu ne sais même pas comment fonctionne leur modèle stupide

oui oui el famoso desco qui publie dans nature allez supprime vite maintenant

Je ne veux pas publier dans tes revues, le golem, jamais je ne supporterai ce modèle stupide, si je publie, c'est sur ma propre revue, avec uniquement mes travaux dessus, ou des partenaires considérés comme fiables, personne n'aura à payer quoi que ce soit pour lire ou publier (mis à part pour mener ses propres travaux, évidemment)

Je ne sais même pas que vient faire ce sujet ici, on parle de la bioinformatique, le PNJ !

Avant de me critiquer sur la base de RIEN (comme toujours avec les golems), va voir les conneries que les autres publient du haut de tous leurs diplômes merdiques (et/ou leurs conflits d'intérêts), c'est que des conneries la plupart du temps, le golem, mais tu dois être trop PNJ pour te rendre compte de tous les biais existants : p-hacking, facteur de confusion, etc. rien qu'au titre de l'article, on peut souvent dire si du bullshit va nous attendre ou non

C'est pitoyable de voir tous ces KHEYS être plus intéressé par le khey que par le sujet en lui même

Merci pour tes topic Antoine forum