Apprivoiser les virus via le génie génétique, plutôt que de les combattre ?

Le 18 juillet 2024 à 10:24:52 :
l'op c'était vraiment toi qui bégayait devant vincent lapierre ou c'est un fake ?

C'est moi, la dernière fois que j'ai expliqué par rapport à la parole, c'était ici :

1. https://www.jeuxvideo.com/forums/message/1260333670
2. https://www.jeuxvideo.com/forums/message/1260338990
3. https://www.jeuxvideo.com/forums/message/1260339422
4. https://www.jeuxvideo.com/forums/message/1260348214
(entre autres, mais il y a tellement de choses à dire sur ma parole, ce n'est pas exhaustif)

Le 18 juillet 2024 à 15:00:15 :
Voter pour les virus mais les combattre en même temps

Les virus nous apprennent beaucoup sur la génétique et la biologie, et aujourd'hui, il ne serait même pas possible d'avoir des vecteurs viraux (thérapie génique) sans copier les gènes de virus connus

Les virus s'adaptent et interagissent avec les humains, donc c'est aussi une chance de mieux comprendre notre fonctionnement, et nous donner des "frameworks" pour aller dans différents endroits, contourner l'immunité, etc.

Il faut être un golem stupide pour vouloir lutter contre tous les virus

D'ailleurs, l'écrasante majorité des virus ne sont pas pathogènes
On ne sait même pas combien ils sont, comme je l'ai expliqué

Le 17 juillet 2024 à 13:37:30 :

Le 17 juillet 2024 à 13:34:55 :

Le 17 juillet 2024 à 13:31:40 :

Le 17 juillet 2024 à 13:31:13 :
T'es bloqué en 2021 khey ?

Je ne parle pas du SARS-Cov-2 / COVID le golem, même si ça peut aussi s'appliquer ici

Vite finançons des études de gain de fonction sur les virus de la coqueluche et de l'hepatite, je ne vois pas ce qui pourrait mal se passer

Le séquençage devient de plus en plus abordable et des séquenceurs coûtent déjà environ 1 000€ et font la taille d'une clé USB, grâce notamment au séquençage par nanopores (qui est toujours du séquençage NGS / shotgun)

À l'avenir, les gens séquenceront leur biotope et leur propre génome de manière proactive (voir la métagénomique virale, spécifique au séquençage shotgun / NGS, vous ne sélectionnez pas ce que vous séquencez, mais ce que vous alignez), les virus dangereux seront ainsi repérés et stoppés ainsi de cette manière

Il y a tout un travail de caractérisation à faire, c'est majoritairement bioinformatique ici, il faut assembler les génomes de novo

La majorité des virus qui nous infectent (de manière chronique ou non), n'ont pas de nom, pas de référence, rien, et pourtant, ils sont séquencés (mais non alignés), on dirait que personne ne veut se donner cette peine, même si ça va sûrement évoluer dans les années à venir

Il suffit de prendre les fichiers FASTQ, aligner avec les séquences du génome de référence humain, et supprimer, ce qui nous donne toutes les autres séquences du biotope

Le piège ici étant qu'il existe de nombreux rétrovirus endogènes, par exemple, des séquences d'HHV6 se retrouvent dans le génome humain, et ne devraient pas être confondues avec une séquence virale ; d'où l'importance de choisir un cadre de lecture long sur le séquenceur (de l'ordre de plusieurs kb, au moins)

Une autre chose, environ la moitié des virus sont à ARN, l'autre moitié ADN

Certains virus possèdent une transcriptase inverse qui leur permettent à un moment ou un autre de faire une conversion en ADN, ce qui sera donc capturé dans le cadre d'un séquençage ADN. Mais pour des virus ARN qui ne font pas de conversion, comme le SARS-Cov-2 (par exemple), il faut en fait séquencer l'ARN

Donc, séquençage ADN + transcriptome est ce qui se fait de mieux