On dit qu'il voulait donner moins de pouvoir à la CIA On dit qu'il avait été aidé par la mafia pour atteindre le pouvoir et qu'il commençait à les éléminer un par un. Jack Ruby en faisait partie d'ailleurs celui qui a tué Oswald juste après son arrestation.
Parce qu’il était en train de contrarier les plans de la mafia Il a aussi causé du tord à des affiliés de la CIA après l’échec de la baie des cochons et son refus d’essayer de virer Castro
La mafia et quelques renegats de la CIA ont décidé de le supprimer