Difficilement.
Déjà si c'est un champignon symbiotique tu peux oublier de le faire pousser sur boîte de pétri.
Sinon faut prendre un milieu généraliste pour les champignon, les faire pousser dedant et ensuite microscope. L'ennui c'est que tu auras potentiellement beaucoup de champignons et donc il sera difficile de savoir lequel est responsable de l'infection.
Donc ça signifie les repiquer un par un et essayer de tous les identifier ce qui peut être très laborieux. Le plus gros problème est que tu ne sais pas ce que tu cherches à la base.