Après s'être rapproché de Milošević, Šešelj a été vice-président du gouvernement serbe entre 1998 et 2000. Lors de la guerre du Kosovo en 1999, son parti fut le seul, après trois mois de bombardements, à refuser de capituler face aux forces de l'OTAN.
Le 23 février 2003, Šešelj se livre au TPIY, qui a retenu contre lui « huit charges de crimes contre l'humanité et six charges de violations des lois et coutumes de la guerre pour sa participation à une entreprise criminelle collective »
Il est accusé d'avoir recruté, formé, financé des miliciens serbes qui ont commis des massacres ; d'avoir tenu, en tant que leader ultra-nationaliste, dans les médias ou devant ses troupes, des propos incitant à la violence, à la persécution de civils et au crime ; d'avoir participé à l'élaboration de l'assaut de plusieurs villes en Bosnie, et l'expulsion de leurs habitants non-serbes. Il aurait bénéficié du soutien de Milošević dans ces entreprises.
https://www.youtube.com/watch?v=UW-g2lRTug8
Qui peut se mettre à la table de ce serbe ultra deter ?