Topic de AntoineForum40 :

Créer sa TAQ polymérase pour des PCR ?

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Afin de faire des RT-qPCR, je voudrais créer ma propre TAQ polymérase et autres réactifs afin de ne pas feed des grosses firmes qui gonflent les prix car souvent destiné à des laboratoires avec des budgets démesurés

Voilà ce que je pourrais faire, j'en aurais pour plusieurs années comme ça

:d) Commander le plasmide de Thermus aquaticus et Pyrococcus furiosus (70$ l'unité environ)
:d) Transformer le plasmide en bactéries (choc thermique ou électroporation)
:d) Ajouter du NP-40 pour garder les enzymes stables
:d) Supprimer les protéines non-voulues en chauffant à 75°C (Thermus et Pyrococcus résisteront car ils sont tous les deux thermophiles, alors que les autres seront dénaturées et précipitées)
:d) Titrer la quantité de polyéthylèneimine utilisée pour précipiter les enzymes (en ajouter trop inhibera la précipitation.)
:d) Titrer la concentration finale en enzymes (trop d'enzymes interfèrera avec la PCR)
:d) Purifier dans un tube de dialyse
:d) Conserver l'enzyme purifiée dans 50 % de glycérol (en aliquotes de 50 à 100 µl) à -80°C et elle sera stable pendant des années. Ils peuvent aussi être conservés à -20°C pendant plusieurs mois.
:d) Lors de la préparation, ajouter de l'albumine de sérum bovin (100 µg/mL) pour aider à combattre une éventuelle contamination par la protéase ainsi qu'aider à stabiliser l'enzyme

Quelques références
Engelke et al., (1990) Purification of Thermus aquaticus DNA polymerase expressed in Escherichia coli. Anal Biochem. 191(2):396–400. An early paper describing the cloning of Taq, including purification details.
-
Farralli et al., (2007) Making Taq DNA Polymerase in the Undergraduate Biology Laboratory. Bios 78(2):69–74. Describes an adapted Taq purification for use in undergraduate teaching labs. Also good if you just wanted to make smaller preps for your own lab.
-
Moazen et al., (2012) Optimization of Taq DNA polymerase enzyme expression in Escherichia coli. Adv Biomed Res. 1:82. Recent report on improved Taq purification.
pTAQ Plasmid Information. Web based resource with many details about Taq, including a full purification protocol.
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[Bio101] Preparation of Taq DNA Polymerase. Another web based Taq purification protocol.

Existe-t-il des petits formats pour congeler à -80°C sans encombrer la pièce ? autrement -20°C fera l'affaire, est-t-il aussi possible de stocker un peu moins, pendant combien de moi l'enzyme restera stable ?

Pour le thermocycleur (vendus minimum 5 000$ par de grandes firmes avec des prix délirants et injustifiés), il existe un projet open source, NinjaPCR (la machine coûte 300$)
Auquel il faut ajuste la NinjaLAMP (50$) permettant de faire un marqueur fluorescent et d'interpréter les résultats

https://ninjapcr.tori.st/en/index.html
https://github.com/hisashin/NinjaPCR
https://github.com/hisashin/NinjaLAMP

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Il existe aussi d'autres réactifs, si ce n'est las totalité, qui peuvent être fait maison totalement ou partiellement permettant ainsi d'économiser des sommes considérables, les grands laboratoires vendent leurs produits à prix d'or car ils ne sont pas destinés aux particuliers, engloutissant ainsi toujours plus de subventions

Il faudrait une imprimante à ADN / ARN open source de ce type https://kilobaser.com/ (projet commercial)
J'aurais de la TAQ polymérase gratuite pour plusieurs années*
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Données du topic

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AntoineForum40
Date de création
17 novembre 2021 à 16:56:12
Date de suppression
17 novembre 2021 à 17:38:56
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