Ça dépend des bibliothèques.
La plupart utilisent la classification décimale Dewey, du nom du bibliothécaire américain Melvil Dewey.
Les connaissances sont classées en grands domaines, eux-même subdivisés en sous-domaines.
Tu as par exemple les 3XX pour les sciences sociales, les 8XX pour la littérature, 9XX pour histoire-géo...
Plus la cote est précise, plus le sujet du livre l'est aussi. Par exemple, 342 est le droit constitutionnel, mais 342.252 2 est le contentieux administratif.
Ensuite, tu as le plus souvent les 3 premières lettres du nom de l'auteur. Par exemple, un livre de Jacques Le Goff pourrait avoir pour cote 940 LEG.
Mais tout ça peut varier, les bibliothèques font chacune leur tambouille parce que ce système est d'un autre temps, bien que très pratique.
Et en fonction de la spécialité de la bibliothèque, d'autres systèmes peuvent être utilisés (en science, notamment)